为了适应种业发展需要，中国种子集团公司对原业务实施主、辅业分离，于2004年8月在海南设立中国种子集团公司三亚分公司，其业务范围是负责广东、广西及海南的种子研发与经营，以及集团公司海南科研基地管理，对内对外代繁代制代鉴定。三亚分公司在中国种子海南公司的业务基础上，以海南三亚这片热土作为平台,以中种集团强大的技术、管理及资金等方面的优势为依托。在稳定海南杂交稻种子市场较大占有率的基础上，进一步拓展华南及东南亚市场。
　　中国种子集团公司三亚分公司拥有雄厚的技术力量、国内先进的仓储、检测等设备和现代化的加工包装线，建有大面积稳定的种子科研及生产基地。三亚分公司始终坚持"诚信为本，质量第一"的宗旨,走"研、产、销"一体化之路，铸造种子精品，服务广大农民。
　　目前，公司自有或独家代理的品种有：Ⅱ优629、丛优9919、特优009、博优691、博优629、特优175、D奇宝优1号（海南、广东）、T优5537（海南），普通品种有博Ⅱ优15、Ⅱ优3550等几十个。